比赛场次 38
比赛名称 20090715
比赛状态 已结束比赛成绩
开始时间 2009-07-15 08:10:00
结束时间 2009-07-15 11:50:00
开放分组 全部用户
注释介绍 2009暑期培训A班
题目名称 相似基因
输入输出 gene.in/out
时间限制 1000 ms (1 s)
内存限制 128 MiB
测试点数 10 简单对比
用户 结果 时间 内存 得分
Gravatarcqw AAAAAAAAAA 0.000 s 0.00 MiB 100

相似基因

★★☆   输入文件:gene.in   输出文件:gene.out   简单对比
时间限制:1 s   内存限制:128 MiB

问题描述

大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了 4 种核苷酸,简记作 A,C,G,T 。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。

在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。两个基因的相似度的计算方法如下:

对于两个已知基因,例如 AGTGATG 和 GTTAG ,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基 - ,例如:

A

G

T

G

A

T

-

G

-

G

T

-

-

T

A

G


这样 , 两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:

那么相似度就是: (-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9 。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:

A

G

T

G

A

T

G

-

G

T

T

A

-

G


相似度为: (-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14 。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。

输入

共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含 A,C,G,T 四个字母。 1<= 序列的长度 <=100 。

输出

仅一行,即输入基因的相似度。

样例

gene.in

7 AGTGATG
5 GTTAG

gene.out

14